坏死和凋亡是细胞死亡的两种方式，坏死的细胞一般加入PI、DAPI即能区分死活，而流式检测凋亡的方法多种多样，最常见的为Annexin V/PI双染法和线粒体膜电位探针JC-1分析法。

左图为Annexin/PI双染法测凋亡，左下象限为活细胞，右下象限为早期凋亡细胞（早期凋亡细胞外翻的PS能和探针Annexin V特异性结合），右上为晚期凋亡和坏死细胞，左上为彻底死亡的细胞。右图为JC-1染色检测凋亡，选择绿色FITC和红色PE通道检测JC-1荧光，正常细胞膜电位正常，JC-1为多聚体状态发红光，细胞发生凋亡时，线粒体膜电位去极化，JC-1变成单体状态发出绿色的光，通过红光和绿光的偏移反应线粒体的膜电位变化。